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随着酶的各种应用形式的发展，酶生物反应器也在发展，除了几种基本形式外，新的酶生物反应器正在开发，酶-膜反应器也在逐渐推广应用。值得注意的是，建立酶反应器是指建立由酶和一定的反应器装置构成的催化应用体系，其中包括催化反应的条件控制。但酶生物反应器同时还可以有更广泛的含义。


在某些情况下，人们往往将酶生物反应器和生物反应器、酶工程或生物工程等概念等同起来考虑。酶工程主要包括三个主要的组成部分：酶的生产、制备和应用，而反应器主要在酶的应用过程中发挥作用，同时还在酶工程中占有中心地位。反应器不仅联系着底物和产物，也联系着酶和产物，还反映出酶工程的水平，并随着酶工程的发展而发展。


酶生物反应器不仅在工农业生产中进行应用，而且可以在分析医药领域中进行应用。
酶生物反应器在分析上可以发挥两个方面的作用：
● 将固定化酶反应器用于酶法分析，主要是在酶电极、酶柱及酶标免疫分析中的应用。
● 酶自动分析体系的建立。
 
酶生物反应器在医药领域也有两个方面的应用：
● 药物酶的固定化与改造，从而克服免疫，延长药物的半衰期并增大疗效。
● “人工脏器”的建立。例如，中空纤维膜式反应器在人工肝脏中的应用，具有起到免疫屏障、允许管内外进行物质交换、可与其他技术如微载体技术一起应用获得高密度、高功能分化的肝细胞生物反应器的优点。